Kurşunlu Külliyesi'nin merkezinde yer alan Kurşunlu Camii, adını kurşun kaplı kubbesinden alır. İnşası 1525 yılında tamamlanan caminin 500. kuruluş yılı, 2025 yılında Odunpazarı Belediye Başkanı Ayşe Ünlüce, Prof. Dr. H. H. Adalıoğlu ve yazar Nizamettin Arslan'ın katılımıyla düzenlenen bir törenle kutlandı.
Caminin bânisi olan Çoban Mustafa Paşa, aynı zamanda bir Mevlevi idi. 1580'li yıllardan itibaren Kurşunlu Külliyesi'ni Mevlevîliğe tahsis ederek, buranın Konya' dan sonra gelen en önemli 15 âsitâneden biri hâline gelmesini sağlamıştır.
Kurşunlu Camii'nin mihrabına oyulmuş Mevlevî sikkesi (başlığı), dünyada bilinen tek örnektir. Bunun yanı sıra, kadınlar mahfilinin arka duvarında tâlik hatla yazılmış "Yâ Hazret-i Mevlâna" ibaresi de dünyada eşi benzeri bulunmayan bir örnektir.
Mevlevihane kapanmadan önce, Kadir Gecesi ve Şeb-i Arûs gibi önemli günlerde Sema Âyin-i Şerifi camide icra edilirdi. Bu âyinlerde mutrıb heyeti kadınlar mahfilinin balkonunda yer alırken, semazenler semayı caminin cemaat bölümünde icra ederdi.